covid-19レジリエンスの遺伝子：対応するDNAマーカーの同定 コロナウイルス耐性と感受性

COVID-19は、同じ受容体である血管拡張酵素2（ACE2受容体）を介して人間のホストに感染し、同様の臨床的および病理学的特徴を引き起こすことで、重症急性呼吸器症候群（SARS）と類似しています。 興味深いことに、受容体結合を担うスパイクタンパク質は、2019-nCoVとSARS-CoVの間で非常に類似しており、これは同じ受容体に対する重要な選択の結果です（Wu。、2020）。 SARSに対する我々の体がどのように防御するかを調べることで、COVID-19に対する我々の体がどのように防御するかが明らかになるかもしれません。 最近のゲノムワイド関連研究（GWAS）により、一部の個人がCOVID-19にほとんど影響を受けないのか、他の個人にとっては、ウイルスが生命を脅かすか、さらには致命的な場合があるのかを説明するための遺伝的変異をより深く理解することができました。

DNAデータを分析するには、まず生のオートソーマルDNAをダウンロードし、安全な場所に保存します。 ここには、次から生のDNAファイルをダウンロードする方法が記載されています。 23andMe, Ancestry DNA, Family Tree DNA, Dante Labs, My Heritage, Genes For Good, Vitagene, and Living DNA.

ステップ2）生のDNAファイルを分析する

テキストエディタ（Text WranglerやNotepadなど）の検索機能を使用して、raw DNAデータを検索します。

raw DNAファイルを開くと、ユニークなSNP ID（rs＃またはi＃）、染色体、位置、ジェノタイプのヘッダーが表示されます。各直接消費者DNA検査会社間では、フォーマットが少し異なります。

以下で説明するDNAマーカーを見て、COVID-19からの悪い回復のリスクを評価します。

SARS-CoV-2に感染した患者の呼吸不全に関連するロシーがいくつかのゲノムワイド関連研究（GWAS）で近年公開されました。3つの研究では、ネアンデルタールから継承される同じ~50 kbのゲノム領域にSNPマーカーが特定されました。 (Ellinghaus D et al., 2020, Zeberg & Pääbo, and Blokland et al., 2020). さらに、これらのGWAS研究では、他の多くのDNAも特定されましたそのマーカー COVID-19に関連付けられており、それぞれこれらのうち、以下の表に示されています。

また、この投稿で取り上げられた他のDNAマーカーには、SARSと関連付けられたrs4804803、人間の呼吸器コロナウイルスNL63、SARSコロナウイルス（SARS-CoV）、および新型コロナウイルス2019-nCoV / SARS-CoV（Li et al。、2017; Lu et al。、2019）と同じ受容体である血管拡張酵素2（ACE2）受容体に位置するものがあります。コロナウイルスのスパイクタンパク質がACE2受容体に一致するように進化したため、タンパク質配列を変化させる変異がある場合、covid-19へのいくつかの抵抗をもたらす可能性があります。 ACE2転写物NM_021804.2からのノンシノニムSNPが以下に示されており、rs199951323など、早期停止コドンを引き起こすSNPが特に興味深い。